通过西格玛适应对分枝杆菌DNA损伤反应的转录控制

导读最近Weber-Ban和Ban小组(IMBB)在ScienceAdvances上发表的一项研究发现,分枝杆菌DNA损伤反应的主要调节因子PafBC利用独特的转录激活机制来

最近Weber-Ban和Ban小组(IMBB)在ScienceAdvances上发表的一项研究发现,分枝杆菌DNA损伤反应的主要调节因子PafBC利用独特的转录激活机制来允许在缺乏规范的启动子上识别启动子-35主题。

在转录水平上,分枝杆菌,如人类病原体结核分枝杆菌,通过两条相互交织的调控途径对DNA损伤作出反应。一种途径构成典型的SOS反应,由RecA和阻遏物LexA调节。另一种最近发现的在调节器PafBC控制下的通路通过转录激活控制大量基因,包括recA。虽然SOS反应的去抑制机制已广为人知,但PafBC的转录激活机制仍然未知。

IMBB的研究人员发现了PafBC采用的一种独特的启动子识别机制。在细菌中,启动子识别通常涉及位于转录起始位点-35和-10位置的两个规范序列基序。然而,依赖于PafBC的启动子可以被认为是“混合的”,因为它们包括规范的-10区域但缺少-35基序,而是在位置-26处具有PafBC特定的序列基序。研究人员使用冷冻电子显微镜和生化实验观察到了一个含有PafBC的转录起始复合物。他们表明,PafBC通过在sigma亚基和DNA之间插入而起到衔接子的作用,从而使RNA聚合酶全酶识别杂合-26/-10启动子,因此这种机制被称为“sigma适应”。

全基因组研究发现,分枝杆菌中的许多启动子缺乏规范的-35基序。因此,依赖于PafBC的“西格玛适应”机制可以代表其他转录因子也采用的广泛的、替代的细菌启动子识别模式的一个例子。

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