2022年1月5日整理发布：EMBL 欧洲生物信息学研究所 (EMBL-EBI)、国立卫生研究院 (NIH) 国家人类基因组研究所 (NHGRI)、NIH 国家关节炎、肌肉骨骼和皮肤病研究所的研究人员及其同事已经确定了新的细菌和真菌物种，以及人类皮肤微生物组中的病毒。

微生物组(微生物群落)无处不在，从海洋和土壤到人体肠道和皮肤表面。皮肤微生物组被认为在皮肤健康和疾病中起着关键作用。皮肤微生物群中的某些微生物与不同的皮肤状况有关，包括痤疮和湿疹。

在这项发表在《自然微生物学》杂志上的研究中，研究人员对取自 12 名健康志愿者不同皮肤表面的 594 个样本中检测到的微生物的基因组进行了测序。将传统的实验室培养与宏基因组测序方法相结合，研究人员能够创建皮肤微生物基因组集合 (SMGC)——人类皮肤微生物组的参考基因组集合。

我们皮肤微生物组的多样性

“我们发现了数以千计的病毒序列，包括许多巨型噬菌体——感染细菌的非常大的病毒——最常见于我们志愿者的手脚表面，”Sara Kashaf 博士说。NIH 和 EMBL-EBI 的学生。“身体的这些区域具有高度多样化的微生物组，这是有道理的，因为我们不断地用手接触环境中的新事物。我们未来的工作将旨在了解这些不同的微生物在这些社区中的作用。”

研究人员使用广泛的实验室培养方法、宏基因组测序和公开可用的皮肤宏基因组来获得对皮肤微生物组内多样性程度的这些新见解。这项研究主要针对来自北美的个体，但未来的工作将旨在使用来自不同人群的样本扩展 SMGC。

“这项工作是朝着获得皮肤微生物组的完整基因组蓝图迈出的重要一步，”NHGRI 高级研究员 Julie Segre 说。“我们希望这些数据能够支持未来的调查，提高我们对皮肤健康和疾病的了解。”

新的真核生物、细菌和病毒

SMGC 集合包括 174 种以前未知的细菌物种、四种新的真核生物和 20 种新的巨型噬菌体——基因组大于 200 千碱基的病毒，是普通病毒的 3-5 倍。研究人员此前一直在研究皮肤微生物组的细菌组成，但并不完全了解。然而，这项研究将已知皮肤细菌的目录扩大了 26%。

“除了我们通常在宏基因组学中恢复的细菌和病毒之外，我们还发现了来自人类皮肤的单细胞真核生物——真菌，如酵母——的 12 个基因组。其中一些基因组已经为人所知，例如马拉色菌，它具有EMBL-EBI 的小组负责人 Rob Finn 说：“我们发现，这些细菌与健康的皮肤真菌群落有关，但也与头皮屑等疾病有关。使用恢复八个已知基因组的相同方法使我们对我们发现的四种新型真核生物充满信心。” . “查看这些新型真核生物的模式后发现，其中一种在志愿者中非常常见，可能在我们许多人身上都能找到。”

所有这些数据将很快作为 MGnify 数据资源中的新基因组目录免费提供，研究人员可以在其中找到大量微生物组 数据集，包括人类肠道。